Сотрудничество с ведущими вузами Уфы — одно из направлений работы Гимназии №3. Ученые помогают ученикам в подготовке к олимпиадам, НПК, организуют экскурсии, проводят консультации для учителей .Многие из учителей гимназии — в прошлом выпускники БГУ и БГПУ. Особенно радует, что в нашу гимназию ежегодно приходят молодые учителя с отличной теоретической подготовкой, творческие, креативные, заряженные на успех. Выпускник физического факультета БГУ Петр Игоревич в этом году принял участие в конкурсе «Учитель года» и стал победителем районного конкурса, абсолютным победителем городского конкурса и победителем республиканского конкурса в номинации «Молодой учитель года». Ректор БГУ Николай Дмитриевич Морозкин вручил гимназии Благодарственное письмо за вклад в укрепление и развитие лучших традиций Башкирского государственного университета в интересах молодежи, общества и государства.